《河南农业大学学报》为《化学文摘(CA)》来源期刊,《日本科学技术振兴机构数据库(JST)》来源期刊,《中文核心期刊要目总览》(2023年版)入编期刊,《中国科学引文数据库(CSCD)》(2023—2024年度)来源期刊,中国科技核心期刊(中国科技论文统计源期刊),中国农林核心期刊(A类),中国科协农林领域高质量科技期刊,多次获得“全国优秀科技期刊”“中国科技期刊方阵双效期刊”“中国高等学校优秀自然科学学报”“中国高校优秀科技期刊”“中国高校科技期刊建设示范案例库优秀科技期刊”“中国农业期刊精品期刊”“中国农业期刊优秀团队”“中国农业期刊最具传播力期刊”“河南优秀出版奖期刊奖”“河南省优秀科技期刊”“河南省优秀高校学报”和“河南省一级期刊”等荣誉称号。